Obszarem gdzie występuje ogromna różnorodność morskich bezkręgowców jest Wielka Rafa Koralowa. Na tę zróżnicowanie składają się wśród innymi: gąbki (Porifera), żebropławy innymi słowy bezparzydełkowce (Ctenophora) również parzydełkowce (Cnidaria) do wnętrza tym krążkopławy (Scyphozoa) czy popularne meduzy, koralowce (Anthozoa), do wnętrza tym władza ukwiały (Actiniaria). Szkarłupnie (Echinodermata), do wnętrza tym jeżowce (Echinoidea), rozgwiazdy (Asteroidea), wężowidła (Ophiuroidea), strzykwy (Holothuroidea), ramienionogi (Brachiopoda). Mięczaki (Mollusca), w środku tym ślimaki (Gastropoda), kałamarnice (Teuthoidea), ośmiornice (Octopoda), ostrygi (Ostreidae), małże (Bivalvia) również chitony (Polyplacophora). Niektóre bezkręgowce są wybitnie jadowite jako np. meduza osa morska (Chironex fleckeri), zetknięcie z którą przypuszczalnie skończyć się śmiercią po kilku minutach, ośmiornice z rodzju Hapalochlaena, które dysponują trucizną o nazwie tetrodotoksyną, w ten sposób potężną, że ta zabija polujące na nie drapieżniki, również dziesięć gatunków stożków (Conidae), ślimaków, który ukłucie jadowitym kolcem być może sprowadzić zgon z powodu trudności z oddychaniem.
Rozgwiazda rogi jelenia cierniowa (Acanthaster planci), żywiąca się zwłaszcza polipami zwyczajowo występuje na rafie w środku małym zagęszczeniu. Jeśli przecież rozmnoży się zbytnio być może uwzględnić do jej zniszczenia. Inne morskie bezkręgowce mogące konstytuować zagrożenie na rzecz istnienia rafy to np. ojczysty jeżowiec płomienisty (Strongylocentrotus purpuratus) plus jeżowiec biały, które wobec braku naturalnych wrogów rozmnażają się wewnątrz nadmiarze plus potrafią wymienić podwodne łąki w środku gołe skały. Wprowadzone obce gatunki małży jako azjatycki (Musculista senhousia), nowozelandzki (Perna canaliculus), południowoamerykański (Mytilopsis sallei) oraz północnopacacyficzny (Asterias amurensis) wypierają rodzime małże.
Morskie skorupiaki wewnątrz australijskich wodach reprezentowane są na wskroś siedem gromad. Najlepiej poznaną z nich jest stado pancerzowców (Malacostraca), do której należą jadalne gatunki. W ciepłych wodach północnej Australii żyje wiele gatunków skorupiaków z mniej więcej dziesięcionogów (Decapoda), i w środku tym kraby, fałszywe kraby (Anomura), kraby pustelniki , homary dodatkowo krewetki. Torboraki (Peracarida) wewnątrz tym skorupiaki obunogie (Amphipoda) również równonogi (Isopoda) występują do wnętrza większej różnorodności do wnętrza zimniejszych wodach południowej Australii. Słabiej poznane gomady to łopatonogi (Remipedia), podkowiastogłowe (Cephalocarida), skrzelonogi (Branchiopoda), Maxillopoda (pąkle, copepods plus splewki (Branchiura)) dodatkowo małżoraczki (Ostracoda). Na Tasmanii żyje natura tasmańskiego olbrzymiego raka (Pseudocarcinus gigas), będący drugim największym gatunkiem raka świata, żyjący w środku głębokiej wodzie także ważący do 13 kg. Żyje też w tym miejscu homar nie posiadający szczypiec Western rock lobster (Panulirus cygnus)